Detail Cantuman

SARS-CoV-2 (Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus-2) merupakan virus penyebab wabah Corona Virus Disease 2019 (COVID-19) yang dinyatakan sebagai pandemi global oleh WHO. Ginseng India (Withania somnifera) adalah salah satu tanaman keluarga Solanaceae yang memiliki kandungan senyawa aktif potensial sebagai antivirus SARS-CoV-2. Penelitian ini bertujuan untuk mengeksplorasi potensi tanaman ginseng India (Withania somnifera) sebagai kandidat obat Covid-19 yang dilakukan dengan metode in silico. Tahapan penelitian yang dilakukan yaitu prediksi aktivitas antivirus, molecular docking, molecular dynamic, prediksi druglikeness serta prediksi profil farmakokinetik ADMET (Absorspi, Distribusi, Metabolisme, Ekskresi dan Toksisitas) senyawa aktif Withania somnifera dan senyawa similar, serta prediksi jalur sintesis dari senyawa. Reseptor target yang digunakan dalam penelitian ini yaitu jenis main protease dengan kode 7DPU, 7RN4, 7NG6 dan 7SI9. Hasil simulasi molecular docking menunjukkan bahwa terdapat 3 senyawa dari masing-masing reseptor dengan nilai afinitas ikatan terendah yaitu (7DPU: withanolide E (-9,3 kkal/mol), 17-hydroxywithaferin A (-9,0 kkal/mo) dan sitoindosides IX (-8,8 kkal/mol)), (7NG6: somniferine (-10,5 kkal/mol), sitoindosides IX (-9,7 kkal/mol) dan withanoside II (-9,4 kkal/mol)), (7RN4: Quercetin 3-rutinoside-7-glucoside (-8,6 kkal/mol), 6,8-Dihydroxykaempferol 3-rutinoside (-8,1 kkal/mol), dan withanolide B (-8,0 kkal/mol)), (7SI9: withanoside II (-10,1 kkal/mol), somniferine (-10,0 kkal) dan 17-hydroxywithaferin (-9,8 kkal/mol)). Pada hasil simulasi molecular dynamic menggunakan OpenMM selama 1 ns menunjukkan 3 senyawa dengan kestabilan yang baik saat berinteraksi dengan reseptor yaitu withanolide E pada 7DPU, quercetin 3-rutinoside-7-glucoside pada 7RN4 dan withanoside II pada reseptor kode 7SI9 sehingga senyawa-senyawa tersebut diprediksi dapat dijadikan kandidat potensial sebagai anti-SARS-CoV-2.