Detail Cantuman

SARS-CoV-2 merupakan virus baru yang ditemukan tahun 2019 di Provinsi
Hubei, China. Virus ini telah menyebabkan wabah COVID-19 dengan tingkat
kematian 0,5-6%. Setahun setelah COVID-19 ini muncul, belum ditemukan obat
pasti dalam penangan terapi, sehingga perlu dilakukan pembuatan dan
pengembangan obat baru untuk anti-SARS-CoV-2. Tujuan dari penelitian ini
yaitu untuk memprediksi aktivitas senyawa Flavonoid yang dapat digunakan
sebagai anti-SARS-CoV-2 dengan metode in silico. Metode in silico yang dipilih
yaitu skrining virtual dengan cara prediksi aktivitas antivirus, prediksi
druglikeness, prediksi farmakokinetika, prediksi toksisitas, dan simulasi
molecular docking. Berdasarkan hasil skrining virtual dari 80 senyawa Flavonoid
yang diuji, terdapat 71 senyawa yang diprediksi memiliki aktivitas antivirus, 64
senyawa yang memenuhi aturan Lipinski?s Rule of Five, 56 senyawa diprediksi
tidak beresiko toksik dan 15 senyawa yang memiliki profil farmakokinetika yang
baik. Sedangkan pada simulasi molecular docking digunakan reseptor target
struktur SARS-CoV-2 main protease dengan ID PDB 5RL4, 5R7Y dan 7BUY.
Nilai ?G yang dihasilkan dari re-docking native ligan pada ID PDB 5RL4, 5R7Y
dan 7BUY yaitu -8,47 kkal/mol, -6,91 kkal/mol dan -6,49 kkal/mol. Pada simulasi
molecular docking terdapat dua senyawa yang memiliki nilai ?G yang lebih
rendah dari native ligan yaitu senyawa Naringin dan rutin. Ketika penambatan
dengan ID PDB 5RL4 senyawa Naringin dan Rutin menghasilkan nilai ?G -10,13
kkal/mol dan -9,57 kkal/mol. Pada penambatan dengan ID PDB 5R7Y
menghasilkan -9,84 kkal/mol dan -8,85 kkal/mol. Sedangkan pada penambatan
dengan ID PDB 7BUY menghasilkan -9,69 kkal/mol dan -8,97 kkal/mol.
Senyawa Naringin dan Rutin memiliki prediksi toksisitas, prediksi aktivitas
antivirus dan profil distribusi yang baik.